.cagefs
.cl.selector
email
logs
mod-tmp
tmp -> mod-tmp
www
Удаление этих папок чревато проблемной работоспособностью вашего аккаунта, а решение этой проблемы производится только пересозданием вашего аккаунта (с удалением всех файлов).
Чтобы восстановить работу PHP и сайта, необходимо восстановить системные конфигурации CageFS и PHP Selector. Для этого необходимо перейдите в интерфейс управления интересующей Вас услуги, затем перейдите в раздел PHP:
Затем сверху нажмите на кнопку "Починить CageFS":
После удачного восстановления, проверьте работу сайтов. Если работа не восстановилась, напишите в поддержку