Версия PHP выбирается отдельно для каждого сайта. В ISPmanager откройте Сайты, дважды нажмите на нужный домен и найдите настройки PHP в блоке Дополнительные возможности.
Порядок смены версии, скриншот формы, проверка результата и возврат прежней версии при ошибке собраны в статье Смена версии PHP в ISPmanager 6.
Перед сменой сохраните резервную копию и проверьте совместимость CMS, темы и модулей. Для команд SSH используется отдельная консольная версия PHP.